本发明属于资源利用和化工分离领域,涉及苯硼酸修饰磁性壳聚糖的制备方法,先利用溶剂热法制得纳米Fe3O4固体,将其分散在水中,与壳聚糖的醋酸溶液混合,反应制得Fe3O4@壳聚糖固体;在碱性溶液中与环氧氯丙烷混合,水洗中性,备用;再将其分散在NaOH溶液中碱化12~48 h,加入含有琥珀酸酐DMF溶液,水浴反应后得羧基化Fe3O4@壳聚糖固体;后与EDC和NHS充分混合,加入3‑氨基苯硼酸反应6~18 h即得。本发明通过表面修饰取代硼酸,使得具有顺式二羟基结构的莽草酸在材料表面富集,且通过磁分离将莽草酸分离,回收利用,实现莽草酸纯度和得率的有效提升。本发明在富集分离以及纯化具有顺式二羟基结构的天然产物领域有较好的应用前景,具有节能环保和方便回收等优点。